1、骨骼遗传病，折耳猫的折耳就是骨骼遗传的最明显特征，因为身体的软骨骨质软化没有发育完善，使得折耳猫的耳朵呈下垂状态，随时间地流逝关节功能也逐渐退化，肢体变得僵硬，后期会出现行动障碍。如，有些病猫尾巴是不能摆动的。
2、呼吸道疾病，折耳猫有骨骼上的遗传病，不仅对四肢活动有影响，对呼吸道的影响也不小。由于软骨发育不良，从而挤压到了呼吸道，呼吸道变窄，折耳猫的呼吸就会变得困难。情况严重的呼吸道疾病，需要去医院扩张呼吸道。此外折耳猫可能因为感冒打喷嚏引发鼻血，所以我们在照顾折耳猫时一定要小心谨慎。
3、心脏病，折耳猫还会有心脏病，因为自身骨骼原因，行动不方便，运动量也很小，否则会引发心脏病。折耳猫的心脏病和人类的癌症相似，通常在发现时已经是晚期了，开始威胁他们的生命。而且一旦有了心脏病，折耳猫就需要终身服药。
4、体质虚弱，折耳猫有这么多的疾病，而且属于遗传性质，它们的体质很虚弱，抵抗力低下，非常容易生病，体重也只有正常猫的三分之二，所以每只折耳猫能生存下来都是不容易的，特别是刚生下来的幼猫，都需要悉心照顾，以便它们能健康成长。